船營區是吉林市的發祥地和古城舊址。早在六萬年前的舊石器時代,便有人類在這里繁衍生息。約在西周初期,開始從母系氏族社會向父系氏族社會過渡,出現原始氏族文化。西漢初年,出現了隸屬中央的少數民族地方政權——夫余國。后因明清兩代在此設船廠和水師營而得名。明永樂十八年(1420年)、洪熙元年(1425年)和宣德七年(公元1432年),明政府3次于此造船,始稱船廠;順治十三年(公元1656年),清政府在此建廠造船,后又設水師營訓練水軍。康熙十二年(公元1673年)建城,設將軍衙,成為當時中國東北地區政治、經濟、文化中心,船廠從此稱吉林烏拉。1936年4月1日正式設吉林市時,始用船營區名。1948年3月9日吉林市解放,成立船營區人民政府。