從上海市綠化市容局發布上海水鳥資源監測結果來看,從2006至2010年,上海水鳥數量正從2006年度的20多萬只次,下降到目前的不足15萬只次。其中冬候鳥和旅鳥的數量下降最為明顯。這與人類活動帶來的自然濕地、棲息地質量下降,人工濕地消失,全球氣候異常等有很大關系。 2010年度,滬上野生動植物保護部門組織對上海地區水鳥棲息情況的16次同步調查,調查區域為崇明東灘鳥類自然保護區管理處核心區、崇明東灘魚蟹塘、崇明北湖、南匯東灘、奉賢邊灘、九段沙自然保護區、寶鋼水庫、三甲港、長興橫沙邊灘和淀山湖等10處。
此次調查共記錄到水鳥112種145001只次,在崇明島境內共記錄到水鳥85種73286只次。從鳥類的種類分布來看,南匯東灘野生動物禁獵區最高,為88種,然而,讓鳥類專家擔憂的是,最近數年除奉賢邊灘的水鳥數量呈緩慢上升、崇明東灘保護區的數量呈上升趨勢以外,其余各區域的水鳥數量均出現下降,其中崇明東灘魚蟹塘和九段沙保護區更是下降明顯。2006年至2010年間,上海冬候鳥和旅鳥的數量也在逐年下降;其中雁鴨類和鸻鷸類的下降最為明顯。
對此,野生動植物保護專家認為,上海的水鳥棲息地正面臨著逐年萎縮是導致水鳥數量逐年下降的主要原因,特別是位于沿海的人工棲息地大面積喪失,造成遷徙和越冬水鳥沒有適宜的棲息地棲息,其中崇明東灘魚蟹塘和南匯東灘禁獵區的棲息地喪失是最為明顯的。